Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmcc1Q69ZZ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmcc1Q69ZZ6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmcc1Q69ZZ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms