Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fgd6Q69ZL1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Fgd6Q69ZL1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Fgd6Q69ZL1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fgd6Q69ZL1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Fgd6Q69ZL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Fgd6Q69ZL1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Fgd6Q69ZL1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fgd6Q69ZL1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.7 ms