Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sp9Q64HY3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sp9Q64HY3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp9Q64HY3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp9Q64HY3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms