Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ca4Q64444 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ca4Q64444 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ca4Q64444 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ca4Q64444 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ca4Q64444 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ca4Q64444 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ca4Q64444 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca4Q64444 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ca4Q64444 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca4Q64444 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca4Q64444 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca4Q64444 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca4Q64444 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca4Q64444 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca4Q64444 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca4Q64444 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca4Q64444 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ca4Q64444 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ca4Q64444 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ca4Q64444 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ca4Q64444 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms