Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zpr1Q62384 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Zpr1Q62384 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zpr1Q62384 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zpr1Q62384 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Zpr1Q62384 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zpr1Q62384 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zpr1Q62384 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms