Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sycp1Q62209 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sycp1Q62209 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp1Q62209 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp1Q62209 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms