Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrxQ61687 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtrxQ61687 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtrxQ61687 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AtrxQ61687 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrxQ61687 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AtrxQ61687 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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