Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vsx2Q61412 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsx2Q61412 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms