Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PapolaQ61183 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms