Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HarsQ61035 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HarsQ61035 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HarsQ61035 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HarsQ61035 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HarsQ61035 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HarsQ61035 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HarsQ61035 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HarsQ61035 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HarsQ61035 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms