Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TmpoQ61033 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TmpoQ61033 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TmpoQ61033 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms