Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift20Q61025 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift20Q61025 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms