Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxg1Q60987 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxg1Q60987 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1138.6 ms