Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stxbp3Q60770 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stxbp3Q60770 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stxbp3Q60770 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stxbp3Q60770 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stxbp3Q60770 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stxbp3Q60770 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stxbp3Q60770 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Stxbp3Q60770 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stxbp3Q60770 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stxbp3Q60770 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms