Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha1Q60715 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4ha1Q60715 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4ha1Q60715 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms