Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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PtprnQ60673 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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PtprnQ60673 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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PtprnQ60673 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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PtprnQ60673 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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PtprnQ60673 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprnQ60673 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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PtprnQ60673 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PtprnQ60673 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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PtprnQ60673 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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PtprnQ60673 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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PtprnQ60673 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PtprnQ60673 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprnQ60673 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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PtprnQ60673 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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PtprnQ60673 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprnQ60673 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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