Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Satb1Q60611 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Satb1Q60611 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Satb1Q60611 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Satb1Q60611 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms