Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdcp1Q5U462 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdcp1Q5U462 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdcp1Q5U462 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms