Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ggnbp2Q5SV77 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ggnbp2Q5SV77 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ggnbp2Q5SV77 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ggnbp2Q5SV77 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms