Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlha9Q5RJB0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Bhlha9Q5RJB0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bhlha9Q5RJB0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms