Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv4Q5R1A3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms