Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsrp1Q5NCR9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nsrp1Q5NCR9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nsrp1Q5NCR9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nsrp1Q5NCR9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms