Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kctd1Q5M956 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kctd1Q5M956 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kctd1Q5M956 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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