Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps41Q5KU39 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps41Q5KU39 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms