Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfmbt2Q5DTW2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfmbt2Q5DTW2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt2Q5DTW2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt2Q5DTW2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt2Q5DTW2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfmbt2Q5DTW2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms