Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Krt35Q497I4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt35Q497I4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt35Q497I4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms