Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a2Q3ZAS0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a2Q3ZAS0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a2Q3ZAS0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a2Q3ZAS0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc9a2Q3ZAS0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc9a2Q3ZAS0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc9a2Q3ZAS0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc9a2Q3ZAS0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a2Q3ZAS0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms