Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
1700123L14RikQ3V2K7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
1700123L14RikQ3V2K7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
1700123L14RikQ3V2K7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
1700123L14RikQ3V2K7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms