Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc185Q3V118 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc185Q3V118 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc185Q3V118 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms