Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc9Q3V038 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9Q3V038 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms