Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc160Q3UYG1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc160Q3UYG1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms