Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc55Q3UY51 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc55Q3UY51 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms