Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Drc1Q3USS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Drc1Q3USS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Drc1Q3USS3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Drc1Q3USS3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms