Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mindy4Q3UQI9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mindy4Q3UQI9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms