Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc1Q3UPH1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc1Q3UPH1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms