Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skap2Q3UND0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap2Q3UND0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skap2Q3UND0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms