Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r7Q3UM45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r7Q3UM45 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r7Q3UM45 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r7Q3UM45 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms