Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf44Q3UHJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf44Q3UHJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms