Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx27Q3UHD6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx27Q3UHD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx27Q3UHD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms