Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Vars2Q3U2A8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vars2Q3U2A8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vars2Q3U2A8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vars2Q3U2A8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms