Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem35bQ3U0Y2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem35bQ3U0Y2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem35bQ3U0Y2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem35bQ3U0Y2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms