Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc9Q3U0M1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc9Q3U0M1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc9Q3U0M1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms