Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Calr4Q3TQS0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Calr4Q3TQS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Calr4Q3TQS0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.1 ms