Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col24a1Q30D77 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col24a1Q30D77 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms