Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd3Q14AI6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd3Q14AI6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd3Q14AI6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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