Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prok1Q14A28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prok1Q14A28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prok1Q14A28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prok1Q14A28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prok1Q14A28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prok1Q14A28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prok1Q14A28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prok1Q14A28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prok1Q14A28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms