Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmntd2Q0VET5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmntd2Q0VET5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmntd2Q0VET5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms