Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne7Q0VE82 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne7Q0VE82 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne7Q0VE82 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne7Q0VE82 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms