Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid2Q0VBB0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid2Q0VBB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid2Q0VBB0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prelid2Q0VBB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prelid2Q0VBB0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prelid2Q0VBB0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms