Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fbln1Q08879 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbln1Q08879 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbln1Q08879 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbln1Q08879 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms